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Blaise Li


Blaise Li

Lors de ma thèse (2004-2008), j'ai travaillé sur la phylogénie moléculaire des acanthomorphes. J'ai agrandi le jeu de données en augmentant la diversité des espèces séquencées. J'ai également obtenu des séquences pour un nouveau marqueur nucléaire: RNF213. Afin d'interpréter au mieux les données, j'ai cherché une manière de synthétiser les résultats obtenus à partir de jeux de données indépendants. Ceci est fait au moyen d'un indice de répétition visant à donner une idée de la fiabilité des clades. Pour en savoir plus, vous pouvez consulter ma thèse disponible ici: http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00331825/fr/. Si vous voulez aller directement aux conclusions phylogénétiques, ça commence à la page 182 du mémoire ou à la page 125 du diaporama de soutenance. La synthèse qui y figure prend en compte des analyses effectuées en utilisant un modèle d'évolution différent de celui utilisé pour l'article sur RNF213 paru dans Molecular Phylogenetics and Evolution (Li et al., 2009 [1]). Dans ce dernier, le logiciel utilisé ne permettait pas de faire varier les paramètres selon la partition des données. Il est donc possible que les arbres de synthèse de la thèse soient plus fiables que les conclusions de l'article.

membre de l'équipe de 2004 à 2008


Références